İzmir’de yeni koronavirüs varyant cinsleri saptandı
İzmir Tabip Odası ve Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlığı Derneği ortak açıklama ile İzmir’de koronavirüs varyantlarının alt tiplerinin saptandığını deklare etti. Açıklamada, “Sağlık Bakanı, Türkiye’de Delta varyantının baskın olduğunu bildirmiştir. Lakin İzmir’de; alfa, beta, gamma ve delta varyantlarındaki en önemli üç mutasyonu hedefleyen PCR kitleri ile yapılan tahlillerde, üç mutasyonu da taşımayan suşlar (alt tür) saptanmaktadır” değerlendirmesi yapıldı.
Koronavirüs salgınındaki son duruma ait İzmir Tabip Odası ve Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlığı Derneği’den (KLİMUD) dikkat çeken bir açıklama geldi. Yapılan ortak yazılı açıklamada, yeni varyantların saptanması ve özelliklerinin araştırılabilmesi için nükleik asit dizi tahlillerinin yaygınlaştırılması ve sonuçlarının açıkça paylaşılması gerektiği vurgulandı.
“TOPLUMLA PAYLAŞIN”
Açıklamada, şu kıymetlendirme yapıldı:
“Covid-19’a niye olan virüsün (SARS-CoV-2) mutasyonlarının dünyada yayılmakta olduğu ve global bir tehdit oluşturduğu görülmektedir. Mutasyon, virüslerin çoğalması sırasında nükleik asit dizilerinde (genomunda) ortaya çıkan değişikliklerdir. Birinci tanımlanan virüse bakılırsa farklı özellikler gösteren mutasyonlu virüslere varyant virüs denmektedir. SARS-CoV-2’nin toplumda süratli yayılması ve çoğalması, virüste yeni mutasyonların ortaya çıkmasına, virüsün varlığını sürdürmesine yardım eden (mesela, kolay yayılmasını, konak hücrelerine daha kolay girmesini, konağın bağışık karşılıklarından kaçabilmesini sağlayan) mutasyonların birikmesine niye olurak varyantların gelişmesine niye olmaktadır. Bu niçinlerle, hastalığın ortaya çıkmasını engelleyecek korunma stratejilerinin geliştirilmesi ve esirgeyici tedbirlerin süratli bir biçimde uygulanması gereklidir. Bunun yapılabilmesi için toplumda var olan varyantların yakın izlemi, yeni varyantların saptanması ve elde edilen dataların başta sıhhat sunucuları olmak üzere toplumla süratli paylaşımı kritik kıymet taşımaktadır.”
“NÜKLEİK ASİT DİZİ TAHLİLİ GEREKİYOR”
Varyant virüslerin toplum sıhhati ve salgının seyri üzerine tesirlerine dayanılarak gruplandırıldığı belirtilen açıklamada şu bilgilere yer verildi:
“Endişe verici varyantlar olarak şu anda alfa, beta, gamma ve delta varyantları tanımlanmaktadır. Ayrıyeten, müşahede altında tutulması gereken ve araştırma altında olan kümelerde epey sayıda varyant bulunmaktadır.
Ülkemizde şu anda esas mutasyonları saptayan farklı PCR kitleriyle varyantlar araştırılmaktadır. Bu kitlerin ve algoritmaların standardizasyonunun sağlanması ile sonuçlar daha âlâ yorumlanabilecektir.
Sıhhat Bakanı, Türkiye’de Delta varyantının baskın olduğunu bildirmiştir. Fakat İzmir’de, alfa, beta, gamma ve delta varyantlarındaki esas üç mutasyonu hedefleyen PCR kitleri ile yapılan tahlillerde, üç mutasyonu da taşımayan suşlar saptanmaktadır. Ayrıyeten, bu mutasyonları farklı kombinasyonlarla taşıyan suşlar da bulunmaktadır. Bu suşların özelliklerinin anlaşılabilmesi için genom tahlili (nükleik asit dizi analizi) yapılması gereklidir. Bu örneklerin bir kısmı Türkiye Halk Sıhhati Genel Müdürlüğü’ne (HSGM) ileri inceleme için yollanmakta, lakin sonuçları hakkında tabiplere ve topluma bir açıklama yapılmamaktadır. İller/bölgeler incelendiğinde enfeksiyon ve aşılama oranlarındaki farklara ek olarak varyantlarda da farklar oluşabileceği beklenmektedir. Varyant PCR testleri ile varyantların araştırılması kâfi değildir. Dizi tahlili yapılacak örneklerin seçim kriterleri toplumdaki enfeksiyon ve hastalık özelliklerine nazaran belirlenmelidir. Bunlar yapılmadığı sürece mevcut varyantların ve yeni gelişecek olanların gözden kaçabileceği unutulmamalıdır.”
BAKANLIĞA DAVET
İzmir Tabip Odası ve KLİMUD, mikrobiyolojik olarak yapılması gerekenleri ise şu biçimde sıraladı:
1. Yeni yahut ek riskler getiren mutasyonları taşıyan varyantların erken saptanabilmesi; nükleik asit dizi tahlili çalışmalarının hızlanması, kapsayıcılığının arttırılması, yaygınlaştırılması ve örnek toplama kriterlerinin belirlenmesi ile mümkündür.
2. Covid-19 olumlu örneklerden temsiliyeti sağlayacak oranda rastgele seçilen örneklerin yanı sıra, belli klinik ve epidemiyolojik özelliklerine göre toplanan örneklerde dizi tahlili yapılması gereklidir. Aşıya ya da hastalığı geçirmiş olmalarına karşın tekrar Covid-19 olanlar, farklı klinik gidiş gösteren yahut uzamış ya da farklı bulaşma özellikleri olan vakalar/ olay kümeleri, varyantın/varyantların risk oluşturduğu yahut yeni bir varyantın bulunduğu ülkelerden gelenler üzere durumlar belirlenip örnekler toplanmalıdır.
3. HSGM tarafınca yapılan dizi tahlillerinin sonuçları nizamlı olarak bir rapor halinde sıhhat çalışanları ve toplumla paylaşılmalıdır.
4. Daha süratli ve sağlıklı sonuçlar elde edilebilmesi için suşlar lokal laboratuvarlarda da değerlendirilebilmeli, dizi tahlilleri yaygınlaştırılmalı, bilgi, birikim ve alt yapı imkanı bulunan merkezler, üniversiteler desteklenmelidir.
5. Farklı suşların bulaşıcılık, bağışıklıktan kaçma, enfeksiyonunun klinik seyri üzere özellikleri incelenmelidir.
Şayet mümkün yeni varyantlar mevcut ise, bunun hayli süratli biçimde paylaşılması ve bu bilgiden hareketle, bu varyantların özelliklerinin tespiti gerekir. Bu bilgiler, bundan daha sonraki süreçte pandeminin seyrinde rol oynayabilecek olan olası yeni varyantlara karşı gerek toplumsal ve gerekse tıbbi manada pandeminin bilimsel gerçeklere dayanarak yönetilmesinde değerli data kaynağı olacaktır.
bu türlü, salgın dinamiklerinin ve alınacak tedbirlerin süratle değerlendirilebilmesi ve lokal gereksinime göre daha faal çaba mümkün olacaktır.”
İzmir Tabip Odası ve Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlığı Derneği ortak açıklama ile İzmir’de koronavirüs varyantlarının alt tiplerinin saptandığını deklare etti. Açıklamada, “Sağlık Bakanı, Türkiye’de Delta varyantının baskın olduğunu bildirmiştir. Lakin İzmir’de; alfa, beta, gamma ve delta varyantlarındaki en önemli üç mutasyonu hedefleyen PCR kitleri ile yapılan tahlillerde, üç mutasyonu da taşımayan suşlar (alt tür) saptanmaktadır” değerlendirmesi yapıldı.
Koronavirüs salgınındaki son duruma ait İzmir Tabip Odası ve Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlığı Derneği’den (KLİMUD) dikkat çeken bir açıklama geldi. Yapılan ortak yazılı açıklamada, yeni varyantların saptanması ve özelliklerinin araştırılabilmesi için nükleik asit dizi tahlillerinin yaygınlaştırılması ve sonuçlarının açıkça paylaşılması gerektiği vurgulandı.
“TOPLUMLA PAYLAŞIN”
Açıklamada, şu kıymetlendirme yapıldı:
“Covid-19’a niye olan virüsün (SARS-CoV-2) mutasyonlarının dünyada yayılmakta olduğu ve global bir tehdit oluşturduğu görülmektedir. Mutasyon, virüslerin çoğalması sırasında nükleik asit dizilerinde (genomunda) ortaya çıkan değişikliklerdir. Birinci tanımlanan virüse bakılırsa farklı özellikler gösteren mutasyonlu virüslere varyant virüs denmektedir. SARS-CoV-2’nin toplumda süratli yayılması ve çoğalması, virüste yeni mutasyonların ortaya çıkmasına, virüsün varlığını sürdürmesine yardım eden (mesela, kolay yayılmasını, konak hücrelerine daha kolay girmesini, konağın bağışık karşılıklarından kaçabilmesini sağlayan) mutasyonların birikmesine niye olurak varyantların gelişmesine niye olmaktadır. Bu niçinlerle, hastalığın ortaya çıkmasını engelleyecek korunma stratejilerinin geliştirilmesi ve esirgeyici tedbirlerin süratli bir biçimde uygulanması gereklidir. Bunun yapılabilmesi için toplumda var olan varyantların yakın izlemi, yeni varyantların saptanması ve elde edilen dataların başta sıhhat sunucuları olmak üzere toplumla süratli paylaşımı kritik kıymet taşımaktadır.”
“NÜKLEİK ASİT DİZİ TAHLİLİ GEREKİYOR”
Varyant virüslerin toplum sıhhati ve salgının seyri üzerine tesirlerine dayanılarak gruplandırıldığı belirtilen açıklamada şu bilgilere yer verildi:
“Endişe verici varyantlar olarak şu anda alfa, beta, gamma ve delta varyantları tanımlanmaktadır. Ayrıyeten, müşahede altında tutulması gereken ve araştırma altında olan kümelerde epey sayıda varyant bulunmaktadır.
Ülkemizde şu anda esas mutasyonları saptayan farklı PCR kitleriyle varyantlar araştırılmaktadır. Bu kitlerin ve algoritmaların standardizasyonunun sağlanması ile sonuçlar daha âlâ yorumlanabilecektir.
Sıhhat Bakanı, Türkiye’de Delta varyantının baskın olduğunu bildirmiştir. Fakat İzmir’de, alfa, beta, gamma ve delta varyantlarındaki esas üç mutasyonu hedefleyen PCR kitleri ile yapılan tahlillerde, üç mutasyonu da taşımayan suşlar saptanmaktadır. Ayrıyeten, bu mutasyonları farklı kombinasyonlarla taşıyan suşlar da bulunmaktadır. Bu suşların özelliklerinin anlaşılabilmesi için genom tahlili (nükleik asit dizi analizi) yapılması gereklidir. Bu örneklerin bir kısmı Türkiye Halk Sıhhati Genel Müdürlüğü’ne (HSGM) ileri inceleme için yollanmakta, lakin sonuçları hakkında tabiplere ve topluma bir açıklama yapılmamaktadır. İller/bölgeler incelendiğinde enfeksiyon ve aşılama oranlarındaki farklara ek olarak varyantlarda da farklar oluşabileceği beklenmektedir. Varyant PCR testleri ile varyantların araştırılması kâfi değildir. Dizi tahlili yapılacak örneklerin seçim kriterleri toplumdaki enfeksiyon ve hastalık özelliklerine nazaran belirlenmelidir. Bunlar yapılmadığı sürece mevcut varyantların ve yeni gelişecek olanların gözden kaçabileceği unutulmamalıdır.”
BAKANLIĞA DAVET
İzmir Tabip Odası ve KLİMUD, mikrobiyolojik olarak yapılması gerekenleri ise şu biçimde sıraladı:
1. Yeni yahut ek riskler getiren mutasyonları taşıyan varyantların erken saptanabilmesi; nükleik asit dizi tahlili çalışmalarının hızlanması, kapsayıcılığının arttırılması, yaygınlaştırılması ve örnek toplama kriterlerinin belirlenmesi ile mümkündür.
2. Covid-19 olumlu örneklerden temsiliyeti sağlayacak oranda rastgele seçilen örneklerin yanı sıra, belli klinik ve epidemiyolojik özelliklerine göre toplanan örneklerde dizi tahlili yapılması gereklidir. Aşıya ya da hastalığı geçirmiş olmalarına karşın tekrar Covid-19 olanlar, farklı klinik gidiş gösteren yahut uzamış ya da farklı bulaşma özellikleri olan vakalar/ olay kümeleri, varyantın/varyantların risk oluşturduğu yahut yeni bir varyantın bulunduğu ülkelerden gelenler üzere durumlar belirlenip örnekler toplanmalıdır.
3. HSGM tarafınca yapılan dizi tahlillerinin sonuçları nizamlı olarak bir rapor halinde sıhhat çalışanları ve toplumla paylaşılmalıdır.
4. Daha süratli ve sağlıklı sonuçlar elde edilebilmesi için suşlar lokal laboratuvarlarda da değerlendirilebilmeli, dizi tahlilleri yaygınlaştırılmalı, bilgi, birikim ve alt yapı imkanı bulunan merkezler, üniversiteler desteklenmelidir.
5. Farklı suşların bulaşıcılık, bağışıklıktan kaçma, enfeksiyonunun klinik seyri üzere özellikleri incelenmelidir.
Şayet mümkün yeni varyantlar mevcut ise, bunun hayli süratli biçimde paylaşılması ve bu bilgiden hareketle, bu varyantların özelliklerinin tespiti gerekir. Bu bilgiler, bundan daha sonraki süreçte pandeminin seyrinde rol oynayabilecek olan olası yeni varyantlara karşı gerek toplumsal ve gerekse tıbbi manada pandeminin bilimsel gerçeklere dayanarak yönetilmesinde değerli data kaynağı olacaktır.
bu türlü, salgın dinamiklerinin ve alınacak tedbirlerin süratle değerlendirilebilmesi ve lokal gereksinime göre daha faal çaba mümkün olacaktır.”